與自然科學基金委員會合作議題：

• 2019 年工業過程廢棄物減量與分離領域
  • 2019 年工業過程廢棄物減量與分離計畫徵求公告
    台灣 - 科技部公告
    大陸 - 國家自然科學基金委員會公告 (相關資訊請見國家自然科學基金委員會公告網址)
• 2018 年太陽能科技領域
  • 2018 年兩岸太陽能科技領域合作研究計畫徵求公告
    台灣 - 科技部公告(2018.04.19修正) (相關資訊請見台灣科技部公告網址)
    大陸 - 國家自然科學基金委員會公告 (相關資訊請見國家自然科學基金委員會公告網址)
• 2017 年智慧輔助科技領域
  • 2017 年海峽兩岸智慧輔助科技領域合作研究計畫徵求公告
    台灣 - 科技部公告 (相關資訊請見台灣科技部公告網址)
    大陸 - 國家自然科學基金委員會公告
  • 2017 年智能輔助科技研究補助名單

與大陸科技部合作議題：

• 2017年生態農業技術領域
  • 2017 年海峽兩岸生態農業技術領域合作研究計畫徵求公告
    台灣 - 科技部公告 (相關資訊請見台灣科技部公告網址)
    大陸 - 科技部公告 (相關資訊請見大陸科技部公告網址)
• 2016 年防災科技
  • 2016 年『防災科技應用』專案計畫徵求公告
    (相關資訊請見台灣科技部公告網址)
  • 2016 年防災科技補助名單
• 2015 年食品安全
• 2014 年『兩岸食品安全合作研究』專案計畫徵求公告
• 2015 食品安全研究補助名單